La decisión de que algunos residentes realicen sus aislamientos en los hoteles es por solicitud de un equipo interdisciplinario del COE, que ante distintas situaciones de riesgo, define que ciertas personas no se queden en sus domicilios a cumplir la cuarentena. 

El área encargada de gestionar el alojamiento y monitorear que las personas tengan todo lo necesario, es la Secretaría de Turismo, mientras que la parte médica es vigilada por el Ministerio de Salud Pública.

En los hoteles se proporciona además de alojamiento y las cuatro comidas diarias, atención médica, psicológica y nutricional. Todos estos servicios son absorbidos por el gobierno provincial, en el caso de los residentes de la provincia el costo es cero. También son alojados los riojanos y riojanas que llegan de otras provincias u otros países, en estos casos abonan el 50 por ciento de su alojamiento y el otro 50 por ciento está a cargo del gobierno provincial. En el caso de las personas que llegan a trabajar en empresas privadas pagan el 100 por 100 de su estadía hasta culminar su aislamiento preventivo.

Cabe destacar que este sistema ayuda al sector hotelero que se encuentra ocupado en La Rioja capital, en un importante porcentaje y a una parte del sector gastronómico que prepara las cuatro comidas. La distribución en los hoteles se realiza en función de que todos los hoteleros puedan tener ocupación y se distribuyan las cargas.

Es preciso destacar que a diferencia de muchos gobiernos del país, La Rioja fue la única provincia donde el alojamiento para los repatriados, en los primeros meses de la pandemia, lo absorbió el gobierno provincial. Además de poner a disposición colectivos, una medida que permitió en los primeros meses de la pandemia volver a sus hogares a muchos riojanos.